Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP1Q8N474 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFRP1Q8N474 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP1Q8N474 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms