Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NME8Q8N427 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NME8Q8N427 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME8Q8N427 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
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