Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC25Q8N386 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC25Q8N386 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC25Q8N386 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms