Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC13Q8IYE1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC13Q8IYE1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC13Q8IYE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms