Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLF2Q8IX21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF2Q8IX21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF2Q8IX21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms