Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LIX1LQ8IVB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LIX1LQ8IVB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIX1LQ8IVB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms