Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT12Q8IV01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT12Q8IV01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms