Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS37DQ86XT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37DQ86XT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37DQ86XT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms