Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF3Q86WH2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF3Q86WH2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF3Q86WH2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms