Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATL1Q86TB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATL1Q86TB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL1Q86TB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms