Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMC4Q7Z404 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TMC4Q7Z404 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMC4Q7Z404 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMC4Q7Z404 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms