Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM15Q7Z3B0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM15Q7Z3B0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms