Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BEND4Q6ZU67 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEND4Q6ZU67 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEND4Q6ZU67 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms