Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R3FQ6ZSY5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R3FQ6ZSY5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R3FQ6ZSY5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms