Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL4Q6ZR62 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms