Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms