Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ALKAL1Q6UXT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKAL1Q6UXT8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ALKAL1Q6UXT8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms