Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBLN3Q6UW01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBLN3Q6UW01 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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