Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNV1Q6PIU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNV1Q6PIU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNV1Q6PIU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms