Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA3EQ6PEY2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3EQ6PEY2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3EQ6PEY2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms