Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC4Q6P2E9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDC4Q6P2E9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC4Q6P2E9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms