Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KANK3Q6NY19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KANK3Q6NY19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KANK3Q6NY19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms