Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP3Q6NUK4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms