Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHLDB3Q6NSJ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms