Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD13Q5VXD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD13Q5VXD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD13Q5VXD3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms