Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF38BQ5VTL8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF38BQ5VTL8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms