Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROCCQ5TZA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROCCQ5TZA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms