Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRTP1Q5TC63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRTP1Q5TC63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms