Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3BQ5T9A4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATAD3BQ5T9A4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3BQ5T9A4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms