Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP188Q5SRE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP188Q5SRE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms