Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC178Q5BJE1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC178Q5BJE1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC178Q5BJE1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms