Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SBK1Q52WX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SBK1Q52WX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms