Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM259Q4ZIN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM259Q4ZIN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms