Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0X4

KCTD21, BTB/POZ domain-containing protein KCTD21, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD21Q4G0X4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD21Q4G0X4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD21Q4G0X4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD21Q4G0X4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD21Q4G0X4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD21Q4G0X4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD21Q4G0X4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCTD21Q4G0X4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD21Q4G0X4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms