Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP13-3Q3SY46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP13-3Q3SY46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP13-3Q3SY46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KRTAP13-3Q3SY46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KRTAP13-3Q3SY46 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KRTAP13-3Q3SY46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP13-3Q3SY46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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