Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF8Q3BBV2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF8Q3BBV2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NBPF8Q3BBV2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms