Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFA9Q16795 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFA9Q16795 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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