Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMN1Q16637 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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