Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDB1Q16531 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDB1Q16531 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDB1Q16531 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDB1Q16531 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
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