Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY1Q16526 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRY1Q16526 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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