Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF1CQ15572 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1CQ15572 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1CQ15572 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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