Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEA2Q15560 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA2Q15560 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA2Q15560 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms