Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX1Q15475 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX1Q15475 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX1Q15475 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX1Q15475 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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