Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRRQ15256 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRRQ15256 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRRQ15256 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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