Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX17Q15036 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX17Q15036 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX17Q15036 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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