Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARB2Q14108 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB2Q14108 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB2Q14108 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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