Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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TNFAIP1Q13829 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNFAIP1Q13829 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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TNFAIP1Q13829 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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TNFAIP1Q13829 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
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TNFAIP1Q13829 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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TNFAIP1Q13829 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFAIP1Q13829 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFAIP1Q13829 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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