Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTMR1Q13613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR1Q13613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR1Q13613 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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