Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNASE1L3Q13609 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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