Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms