Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAE1Q13564 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAE1Q13564 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
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